本書以「蔣中正的一九四九」為題，並不準備對蔣中正在一九四九年的各項作為進行研究，而是將重點置於蔣中正自一九四九年一月下野至一九五○年三月復行視事一年多的時間中，探討他如何再起？再起的過程與機遇。全書除前言、結論外，分為五章：第一章「第三次下野」，探討蔣氏決定下野的原因，以及下野之經過；第二章「從溪口到臺北」，敘述蔣氏下野後，居留溪口的生活，以及轉赴上海、舟山、臺灣等地之過程；第三章「建立黨政關係常軌」，分析蔣氏在杭州會談、成立非常委員會，以及閻錫山出任行政院院長等事中的地位；第四章「維護大陸最後據點」，探討蔣氏兩度至西南的情形，以及其在李宗仁出國後，角色如何轉換，從幕後走上前台；第五章「在臺復行視事」，探討蔣氏個人對於復任總統問題的認知，以及復職一事進行之經過。

本書重點在探討蔣中正在一九四九年下野之後，如何重新再起，復任總統的過程，以及他個人對相關問題的思考、判斷。資料方面以蔣氏所留存相關資料，包括國史館庋藏《蔣中正總統檔案》、《蔣經國總統檔案》與蔣氏家屬所保存《蔣中正日記》； 及史政單位所收集或保存之蔣氏相關資料，如中國國民黨中央文化傳播委員會黨史館藏《總裁檔案》、《會議記錄》等為主。此外並參閱相關當事人留存之資料，如張群之《中行廬經世資料》，邱昌渭往來函電，張群、吳忠信、徐永昌、閻錫山、居正、胡宗南、丁治磐、雷震等日記，以及李宗仁、黃旭初、程思遠、蔣經國等回憶錄。