《内蒙古自治区第三次全国文物普查新发现》是国务院部署的重大国情国力调查，是当前我国最大规模、最首要的文化遗产保护工程，对我国文化遗产保护事业和经济社会发展全局具有重要意义。2006年，内蒙古自治区被国家文物局确定为第三次全国文物普查试点单位。为此，自治区文化厅、文物局在自治区文物考古研究所成立了全区第三次文物普查办公室，组织领导普查试点工作。鉴于我区地域广阔，从东到西在自然环境、文博工作基础等各方面存在较大差异，所以试点分别选在位于自治区东部、中部、西部的赤峰市、呼和浩特市、阿拉善盟同时进行。2006年2月底至3月初，全区第三次文物普查办公室组织举办了“内蒙古自治区第三次全国文物普查试点学员培训班”，对试点单位的业务骨干进行了专门的培训。全区第三次文物普查办公室为各试点单位配备了台式电脑、光学相机、数码相机和GPS定位仪等设备。各旗县政府在财政普遍紧张的状况下，都划拨了数额不等的普查专项经费。在2006年的试点工作中，3盟市所辖24个旗县共组建了21支普查队伍，动用人力约2万人次，普查面积约16万平方公里，普查不可移动文物点3841处，其中复查2068处，新发现1773处。与第二次文物普查相比，文物点数量将近翻了一番。