《云南历史文化名城研究》是作者通过30年文物工作实践，对云南历史文化名城作学术性、知识性及地域性探索的一本专著。该书从历史文化名城理论研究人手，对云南各民族历史进程和城市的形成作了积极探索。

木基元所著的《云南历史文化名城研究》在大量阅读文献资料和运用考古发现的基础上，作者深入到云南13座国家(省)级历史文化名城实地调研，从历史学、文化人类学的视角，展示了各名城的文化内涵及特色，并就保护、发展与利用大胆地提出了自己的观点：认识是基础，规划是前提，保护是关键，发展是出路。对近年来云南历史文化名城的保护研究现状也作了简明扼要的评述，书中配以作者拍摄的150多张照片，穿插了许多丰富的图表资料，增强了可读性及立体感。著名文物保护专家谢辰生评价该书填补了从历史和文化领域研究云南历史文化名城的空白，是30年来云南历史文化名城保护研究的科学总结。在文化越来越受重视的当下，该书对云南历史文化名城的保护，对云南文化遗产的继承与弘扬，具有较高的理论价值与指导意义。